Klanen följer flera människors livsöden i Sollentuna, där två barn föds samma dag men växer upp under helt olika förutsättningar. Josef formas av en vardag där den kriminella Mansourfamiljen successivt tar kontroll över området, medan Antonia lever ett till synes tryggt liv i en välbärgad villaförort. Samtidigt försöker polisen Hjalmar bromsa en utveckling där den organiserade brottsligheten får ett allt starkare grepp om samhället.
Genom flera perspektiv skildrar Pascal Engman hur lojalitet, makt, familjeband och sociala skillnader påverkar människors val och framtid. Klanen är en intensiv kriminalroman och ett samtidsdrama som utforskar gängkriminalitet, hederskultur och kärlek i ett Sverige där gränsen mellan rätt och fel blir allt svårare att dra.